2005年麥可被控猥褻兒童案獲判無罪之後，從歌壇隱退，一直過著深居簡出的生活。不出唱片也難得開演唱會的他，卻要強自支撐著一個巨大的莊園、維持著每次出行的排場和他一貫堅持的慈善活動。

2003年11月19日，麥可的新歌加精選專輯正式發行，原本這應該是一個令廣大麥可的歌迷欣喜的日子，但是這一天卻變成了歌迷們和麥可本人的噩夢。

1997年5月4日，麥可的最新專輯《BLOOD ON THE DANCE FLOOR》面市了，在製作這張專輯的過程中，麥可力邀多位流行樂、搖滾樂的知名藝人與他合作，如“男孩到男人”樂隊，吉它手斯萊士等人，尤其是妹妹珍納傑遜更是與麥可共同演唱。

就在麥可馬不停蹄地在“HISTORY”中輾轉時，他的個人生活也發生了巨大變化。11月4日，麥可向媒體宣佈，洛杉磯整形醫院的護士黛比小姐已懷上他的孩子，他們的孩子將於1997年2月出世。

麥可與莉莎的婚姻還不到半年，就有消息說他們之間的婚姻已經出現了裂痕。這年12月初，莉莎帶著2個孩子從紐約飛回了加州。按理說，母子3人應該居住在麥可的私人王國——夢幻莊園裡，但他們並沒這樣做，而是仍然居住在莉莎以前在海頓山上的寓所里。

麥可的生活隨著他與莉莎瑪麗皮禮士利結婚後有了很大的轉折。其實從娶莉莎一事中，麥可想得到甚麼一目了然。由於性騷擾男童的指控糾纏不休而且仍面臨可能的刑事指控，麥可成為一心一意的丈夫和繼父，顯然可大獲其利。

1994年初，麥可的生活隨著他與莉莎瑪麗皮禮士利的關係進展而發生了一次夢幻般的轉折。早在1988年，這最為奇特的一對就已開始接觸。當時莉莎瑪麗剛與丈夫丹尼基奧分居，麥可則去安慰她。也就是那裡，莉莎瑪麗告訴麥可她快生小孩了，而他則主動要求做這未出世孩子的替身父親。在孩子，一名女孩出生之後，莉莎和基奧又重歸於好。

被告性騷擾男童喬依一案，麥可在任何時候都說自己是清白無辜的，他呼吁儘快結束這一恐怖的經歷。他怒斥“不可相信而且令人可怕的”新聞媒體炒出許多“令人作嘔的說法。”

麥可在墨西哥城最後一場演唱會後，偷偷溜上了泰勒包租的727客機，躲過了在聖胡安機場等著拘留收審麥可的美國官員們，沒有人知道他去了何處。

喬依蘭多的生父亞當蘭多認定麥可傑遜曾經控性騷擾他兒子喬依，並對他提出控告。

1993年7月11日，法官費爾茲同意讓喬依與其生父呆上一週。次日，喬伊母親安被迫簽署一份法庭判決，同意沒有孩子父親的書面準許不得將喬依帶出洛杉磯。她還被告知“不得準許未成年兒童以任何直接或間接方式（包括，但不限於電話方式）與第3方成年男子麥可進行接觸或聯繫。”